Przedmiotem programu studiów w ramach koncepcji złożonych dziedzin biomedycyny jest problematyka procesów fizycznych zachodzących w organizmie żywym, wpływu czynników fizycznych na organizmy żywe oraz zastosowania nowoczesnych metod fizycznych w dziedzinach biomedycyny. Biofizyka, jako dziedzina interdyscyplinarna, oferuje studia doktoranckie absolwentom uczelni wyższych różnych specjalności (medycyna, nauki przyrodnicze, matematyka, fizyka itp.). Program studiów realizowany jest we współpracy z Instytutem Fizjologii Akademii Nauk Republiki Czeskiej.

Historia medycyny jest interdyscyplinarną dziedziną zajmującą się historią nauk medycznych, historią poszczególnych specjalności i ich przedstawicieli, historią zawodu lekarza i rozwojem myśli medycznej, historią kształcenia pracowników służby zdrowia, historią zdrowia publicznego i zakładów opieki zdrowotnej, występowanie i zmiany jednostek chorobowych oraz ich leczenie. W szkołach medycznych i uniwersytetach na świecie historia medycyny ma wielowiekową tradycję. Instytut Historii Medycyny i Języków Obcych (zwany dalej „Instytutem”) Uniwersytetu Karola – I Wydział Lekarski, jeden z pierwszych w Europie, działa na najstarszym wydziale medycznym w Czechach od 1920 roku. Studia w tym kierunku umożliwiają absolwentom wydziałów lekarsko-przyrodniczych i różnych kierunków humanitarnych do osiągnięcia najwyższego wykształcenia specjalistycznego w tej dyscyplinie. Instytut, jako jedyny w tej specjalności, jest centralną instytucją koordynującą kształcenie doktorantów. studenci historii medycyny dla innych szkół uniwersyteckich w Pradze i w całym kraju. Zgodnie z art. 3 ust. 1 zdanie drugie Kodeksu postępowania rekrutacyjnego Uniwersytetu Karola program studiów realizowany jest bez specjalności.

Program studiów doktoranckich „Medycyna zapobiegawcza i epidemiologia” wykorzystuje zasady medycyny opartej na faktach do oceny wpływu różnych czynników (fizycznych, chemicznych, środowiskowych, biologicznych) na zdrowie człowieka na poziomie indywidualnym i populacyjnym w celu zidentyfikować możliwe podejścia do zapobiegania. Program integruje wiedzę i podejścia wywodzące się z dziedzin toksykologii, biologii molekularnej, immunologii, w tym dyscyplin o charakterze klinicznym. Program stanowi podstawę teoretyczną dla dyscyplin profilaktycznych w medycynie, np. zdrowia publicznego, epidemiologii i biostatystyki.